Авторизация
Август 2017
  • Пн
  • Вт
  • Ср
  • Чт
  • Пт
  • Сб
  • Вс
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
  • 23
  • 24
  • 25
  • 26
  • 27
  • 28
  • 29
  • 30
  • 31
Принять участие в конкурсе

Белок-нуклеиновая идентификация: новый метод классификации Белков, основанный на Белок-нуклеиновом взаимодействии

09 июня 2015
Автор: Администратор
Просмотров: 454Комментариев: 0

А.С. Крылов, Р.И. Жданов
НИИ общей патологии и патофизиологии РАМН, Москва, Россия
Казанский (Приволжский) федеральный университет, Казань, Россия
Московский государственный гуманитарный университет им. М.А. Шолохова, Москва, Россия

ЖУРНАЛ:
гены & клетки  Том IX, № 3, 2014

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА:
Классификация  белков,  белковонуклеиновое узнавание, олигонуклеотиды, биочип.
Protein classification, nucleic acid – protein recognition, oligonucleotides, microarray.

АННОТАЦИЯ:
Для  классификации  белков  используется  несколько универсальных  свойств  белковых  молекул.  Некоторые белки способны специфически связываться с ДНК и РНК. В данной работе предлагается простой  метод  для  сравнения  белков,  связывающихся  с  нуклеиновыми  кислотами, который мы назвали «nucleic acid-protein fingerprint».  
Метод базируется на использовании коротких олигонуклеотидов, иммобилизованных в ячейках гидрогеля, для гибридизации их с белками. На первой стадии был определен самый  короткий  олигонуклеотид,  способный  специфически связываться с ДНК. Эксперименты с с образцами от 2  до  12  оснований  показали,  что  тетрамеры,  состоящие из двух универсальных оснований – 5-нитроидол и только 2 обычных основания способны к узнаванию белков. Таким образом, был создан простейшей универсального биочип для  связывания  белков,  состоящий  из  16  значимых  динуклеотидов.  Физическая  длина  этих  нуклеотидов  равна 4, где 2 звена 5-нитроиндол а два звена – обычные основания ДНК Мы изготовили такой биочип и исследовали связывание с ним белков, меченых красителем Texas Red.
Паттерны гибридизации двух белков RNase A и Binase показал заметную специфичность и различия между ними. Биочип такой же конструкции, который содержит три или четыре значимых основания должен иметь еще большую специфичность.  Таким  образом,  нами  был  предложен и экспериментально подтвержден совершенно новый и универсальный принцип классификации белков.

Several basic properties of proteins are used for their classification. Some proteins can bind DNA and RNA in a specific way. We propose a simple method for classification of nucleic acids binding proteins which we call «nucleic acidprotein fingerprint».

СТАТЬЯ

Восстановление пароля

Логин или E-mail